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NovelBrain?單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期圓滿落幕

時(shí)間：2020-01-16 | 閱讀量：3690

2019年12月16 -20日，NovelBrain®單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第一期開班授課。本期學(xué)員分別來自上海、北京、南京、山西、江西等地的各大高校、科研院所及各附屬醫(yī)院，包括中科院生物物理所、中科院上海生命科學(xué)研究院、北京航空航天大學(xué)、海軍軍醫(yī)大學(xué)、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、九江學(xué)院等科研院所以及上海市第一人民醫(yī)院、上海市第十人民醫(yī)院、瑞金醫(yī)院、長海醫(yī)院、中山醫(yī)院、長征醫(yī)院、仁濟(jì)醫(yī)院、新華醫(yī)院、宣武醫(yī)院、東方肝膽外科醫(yī)院、北京天壇醫(yī)院、山西白求恩醫(yī)院、南京鼓樓醫(yī)院等附屬醫(yī)院。

本次課程由烈冰講師“天團(tuán)”進(jìn)行授課：技術(shù)總監(jiān)張博、項(xiàng)目總監(jiān)洪艷艷、生信主任郭云雷齊上陣，向?qū)W員講授單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)&數(shù)據(jù)分析，包括：單細(xì)胞測序研究進(jìn)展及細(xì)胞捕獲原理介紹、測序數(shù)據(jù)分析策略解讀、單細(xì)胞測序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理、分析平臺實(shí)踐上機(jī)操作及結(jié)果文件解讀、分析結(jié)果圖形化展示以及單細(xì)胞懸液制備和捕獲實(shí)驗(yàn)操作等。

培訓(xùn)內(nèi)容：

單細(xì)胞測序研究進(jìn)展及細(xì)胞捕獲原理	l 單細(xì)胞測序研究進(jìn)展； l 兩大主流平臺10×和BD單細(xì)胞捕獲原理； l 10×和BD單細(xì)胞捕獲的優(yōu)缺點(diǎn)； l 10×和BD建庫方法； l TCR、BCR、靶向測序、Ab-Seq等技術(shù)相關(guān)知識介紹；
單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)及案例分析	l 單細(xì)胞測序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——腫瘤； l 單細(xì)胞測序經(jīng)典文獻(xiàn)解讀——神經(jīng)；
單細(xì)胞測序原始數(shù)據(jù)預(yù)處理	l 10×和BD下機(jī)原始數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)講解； l 10×和BD 不同平臺的數(shù)據(jù)預(yù)處理策略； l 細(xì)胞數(shù)量判斷； l 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估； l 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化；
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析策略	l 單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析流程，包括細(xì)胞類型鑒定、擬時(shí)序分析、SCENIC分析、CellPhone、inferCNV等等； l 單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析涉及的相關(guān)生物信息學(xué)算法和數(shù)據(jù)庫的介紹和選擇；
單細(xì)胞云平臺介紹及上機(jī)實(shí)踐操作	l 單細(xì)胞云平臺功能模塊介紹，包括項(xiàng)目管理、工作流搭建、數(shù)據(jù)進(jìn)程監(jiān)控、結(jié)果報(bào)告和單細(xì)胞瀏覽器等； l 單細(xì)胞云平臺實(shí)際操作，包括新建項(xiàng)目、上傳數(shù)據(jù)、搭建Pipeline、數(shù)據(jù)分析；
單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果圖形化展示	l 如何通過云平臺獲得可供SCI發(fā)表的圖形化結(jié)果
單細(xì)胞結(jié)果解讀及參數(shù)調(diào)試	l 單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析結(jié)果文件解讀； l Task參數(shù)在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的重要性
單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)注意事項(xiàng)	l 單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)基本流程； l 單細(xì)胞懸液制備注意事項(xiàng)；
單細(xì)胞懸液制備和捕獲實(shí)驗(yàn)操作	l 小鼠來源樣本單細(xì)胞懸液制備； l WTA/Ab-Seq實(shí)驗(yàn)演示；

每天課程結(jié)束，烈小冰都會收集整理學(xué)員的反饋意見，針對學(xué)員提出的問題和意見及時(shí)對課程進(jìn)行調(diào)整和完善，保證學(xué)員可以在高強(qiáng)度課程中吸收重點(diǎn)內(nèi)容，讓每位學(xué)員聽得懂、記得住、做得會、玩得轉(zhuǎn)單細(xì)胞測序~

為了使學(xué)員們能有足夠的能量應(yīng)對高強(qiáng)度的學(xué)習(xí)壓力，烈小冰悉心準(zhǔn)備了豐富的飲品零食、水果，還有豐盛的午飯，為大家創(chuàng)造更好的培訓(xùn)環(huán)境。

課程結(jié)束之后，學(xué)員進(jìn)公司參觀，并獲得本次培訓(xùn)班的結(jié)課榮譽(yù)證書，以鼓勵(lì)各位學(xué)員認(rèn)真的學(xué)習(xí)態(tài)度。

錯(cuò)過第一期培訓(xùn)的老師不要著急，烈冰單細(xì)胞測序&數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班第二期正在加緊籌劃中~ 2020年，烈小冰與您不見不散！

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