轉(zhuǎn)錄組分析平臺常見，但操作絲滑流暢的分析平臺，還得看烈冰的CytoNavigator^TM2023年9月發(fā)布至今，半年時間已有100多個課題組使用烈冰生物的CytoNavigator^TM單細胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)挖掘單細胞生物學(xué)意義。烈冰團隊再接再厲，開發(fā)了CytoNavigator^TM轉(zhuǎn)錄組分析系統(tǒng)，全流程打通了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，并實現(xiàn)了毫秒級響應(yīng)的GO/Pathway、網(wǎng)絡(luò)分析，以及高可交互的WGCNA、GSEA、趨勢分析等高級數(shù)據(jù)分析！

圖1：CytoNavigator 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)的差異基因頁面

轉(zhuǎn)錄組分析流程成熟，分析平臺眾多。但目前的分析系統(tǒng)普遍存在結(jié)果碎片化、分析不夠流暢，可交互性差，需反復(fù)上傳基因表格等問題。基于上述情況，擁有多年轉(zhuǎn)錄組及生信云平臺經(jīng)驗的烈冰生物重拳出擊！

正式推出CytoNavigator^TM 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)！一次解決RNA-seq分析的痛點，讓您享受數(shù)據(jù)分析的過程，輕松獲得高質(zhì)量文章級圖片。

01 烈冰的傳統(tǒng)強項-轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)

烈冰生物自2010年起即深耕轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域，公司自主研發(fā)了多個轉(zhuǎn)錄組相關(guān)算法，如發(fā)表在期刊核酸研究以及Briefings In Bioinformatics上的差異可變剪接算法ASD和CASH等；并助力研究團隊發(fā)表Nature、Cancer Cell在內(nèi)的300+ 高質(zhì)量轉(zhuǎn)錄組相關(guān)學(xué)術(shù)期刊文章，如助力中科院頂級研究團隊在Nature發(fā)表全球首例自閉癥猴模型等。

圖2：引自 Liu Z, et al. Nature., 2016

2023年9月，烈冰上線了CytoNavigator^TM單細胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，并在全國開展了多次線下培訓(xùn)班，獲得了大量老師的認(rèn)可和使用。

本次我們推出的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)側(cè)重分析的全面性、靈活性和流暢性，用戶可在平臺上流暢進行各類數(shù)據(jù)分析，快速挖掘數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義。

02 烈冰轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)優(yōu)勢

可交互頁面全面覆蓋各類分析

圖3：WGCNA分析頁面，選擇基因module后實時展示該基因module所影響的Pathway

系統(tǒng)全面覆蓋差異基因、功能分析、聚類分析、網(wǎng)絡(luò)圖、GSEA、趨勢分析、WGCNA等多種高級數(shù)據(jù)分析模塊。每個分析模塊均可隨意調(diào)整參數(shù)，并進行深度分析。

功能分析和網(wǎng)絡(luò)分析圖毫秒級展示

圖4：對差異基因進行交并集分析，并對結(jié)果進行各類功能分析

毫秒級計算比較組之間的交集和并集，調(diào)整差異基因的卡值（P_value、FDR）后實時計算網(wǎng)絡(luò)圖、各種功能分析和聚類分析圖，順滑繪圖。

用戶界面友好，分析功能全面

圖5：清晰的分析流程，全面覆蓋各類高級分析，并支持一鍵提交分析

支持多種主流的數(shù)據(jù)分析工具和算法包，用戶可一鍵提交整個分析流程，也可根據(jù)需要修改各類參數(shù)進行定制化分析，兼顧一鍵分析和反復(fù)調(diào)參。

清晰全面的幫助文檔，降低學(xué)習(xí)成本

圖6：每個分析工具均提供全面的幫助手冊

幫助手冊助力用戶進行高效的結(jié)果解讀。

分析高度可定制化

圖7：可實時查看每個趨勢所包含的基因，并對其進行功能分析

單頁面同時展示基因表達、趨勢、火山圖、GO/Pathway、KEGG map、PPI網(wǎng)絡(luò)等一系列分析。同時每個結(jié)果都支持用戶自行調(diào)整結(jié)果，實時出圖。

當(dāng)然，CytoNavigator RNA-Seq數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)還不止這些優(yōu)點，還有樣本分組高可回溯性，支持多用戶協(xié)作和數(shù)據(jù)共享等，更多的平臺功能等你來探索！快來登錄注冊吧~

03 平臺注冊流程

瀏覽器輸入sc.novelbrain.com 進入登錄頁面。

新用戶需要先注冊（注冊邀請碼聯(lián)系駐地銷售或者發(fā)送郵件至tech@novelbrain.com），老用戶直接登錄。

點擊新建項目（不熟悉的可以點擊新手引導(dǎo)查看流程），根據(jù)需求選擇single cell或Transcriptome分析；如選擇Transcriptome，點擊云流程選擇fastq起始或者表達量矩陣起始。

填寫項目名稱、選擇分析物種，點擊創(chuàng)建項目，進入主分析頁面。