烈冰NovelBrain®云平臺自上線以來,受到了廣大科研工作者以及企業(yè)的高度關(guān)注,并接受了眾多科研團隊的全方位、多層次的平臺功能和安全測試,在業(yè)界內(nèi)掀起了一股NovelBrain云計算風(fēng)潮。
烈冰一直以“Novel”為準(zhǔn)則,向大家傳遞新的知識、新的方法、新的技術(shù),以及新的產(chǎn)品。作為烈冰科技耗時八年推出的重量級產(chǎn)品,NovelBrain®云平臺更是致力于向所有科研和醫(yī)療行業(yè)工作者提供更新的、更便捷的、更高效的數(shù)據(jù)分析體驗,讓每一個普通人都可以輕松了解自己數(shù)據(jù)的價值,并賦予數(shù)據(jù)生物學(xué)意義。
為實現(xiàn)NovelBrain的崇高愿景,不斷進行自我更新,增加大數(shù)據(jù)分析計算產(chǎn)能,完善平臺運行機制,成為了NovelBrain®云平臺持續(xù)發(fā)展的必要環(huán)節(jié)。事實上,NovelBrain的研發(fā)團隊一直在努力,NovelBrain®云平臺從V1.0升級到V2.0,在給用戶帶來更多驚喜體驗的同時,我們也在更細(xì)致地去思考自身的不足。值烈冰8周年之際,再次更新升級的V3.0版本攜新功能驚艷面世,實現(xiàn)了NovelBrain的里程碑式飛躍!
新的V3.0上線了GCN(基因功能網(wǎng)絡(luò)繪制軟件),增加了自動化彈性結(jié)果報告系統(tǒng),完善了科學(xué)前沿的生物信息學(xué)工具和人機交互文檔,同時還實現(xiàn)了人類基因組重測序分析的大幅度加速,4小時即可完成單樣本的分析,打破了人重分析的瓶頸。具體更新內(nèi)容見下表:
看到這兒,大家可能還無法get到這波更新的意義所在,莫慌,烈小冰下面就帶您了解更新后的NovelBrain®云平臺V3.0可以實現(xiàn)的強大功能~
從該表可以看出,NovelBrain®云平臺針對不同客戶群體的多方面需求,在V2.0版本的基礎(chǔ)上進行了再次重大升級,全方位優(yōu)化不同用戶的使用體驗。
針對不同需求的用戶,平臺主要做了以下幾點改進:
1. 提供了更準(zhǔn)確和易懂的各類文檔。幫助用戶在毫無生信基礎(chǔ)的情況下,也能輕松上手平臺操作,快速準(zhǔn)確靈活地整合生物信息軟件及Pipeline;
2. 增加了大量前沿的分析工具。不僅涵蓋有甲基化、宏基因組、群體遺傳和單細(xì)胞測序等分析,同時還緊追業(yè)內(nèi)前沿進展,定制化開發(fā)了生物學(xué)意義挖掘模塊;
3. 重點加強了報告可視化,可讀性和關(guān)聯(lián)性更強,可自動瀏覽結(jié)果報告。上線了自主開發(fā)的GCN功能網(wǎng)絡(luò)可視化軟件,可以在結(jié)果中直觀展示生物學(xué)意義的功能傳導(dǎo)路徑。增加了自動化結(jié)果報告判讀系統(tǒng),方便醫(yī)療客戶在報告中快速了解臨床信息;
4. 自主開發(fā)NB三重調(diào)度加速框架,最終實現(xiàn)了人類重測序分析的大幅度加速,4小時即可完成單樣本的測序分析,較傳統(tǒng)的分析方法提高了十多倍速度;
5. 針對大型研究室、測序工廠和企業(yè)用戶,NovelBrain®云平臺V3.0額外升級了一系列的功能,降低了第三方軟件上線的工作量。針對科學(xué)研究的復(fù)雜性和可重復(fù)性,烈冰舍去復(fù)雜的文件配置,一鍵命令即可添加第三方軟件上線;對虛擬鏡像管理界面進行了全方位優(yōu)化,Docker鏡像管理一體化;本著跨界共享的精神,開放了眾多平臺接口,更靈活地進行平臺對接,隨心所欲地進行軟件二次開發(fā)。
對NovelBrain®云平臺有一定了解的老師可能知道,為了滿足不同用戶的實際需求,NovelBrain®云平臺共推出了4款產(chǎn)品供大家選擇,分別是:Solar企業(yè)版公有云、Diamond私有云、Legend一體機和Skywalker公有云。關(guān)于以上的更新內(nèi)容,4款產(chǎn)品中存在些許差異,譬如Legend一體機和Skywalker公有云中,考慮到性能和安全性問題,暫時沒有添加第三方軟件的功能和API開放的升級。詳情見下表:
經(jīng)過此次升級,NovelBrain®云平臺V3.0成為數(shù)不多的上線基因功能網(wǎng)絡(luò)繪制軟件的生物云平臺之一。接下來,烈小冰向大家著重介紹一下烈冰自主開發(fā)的GCN功能網(wǎng)絡(luò)可視化軟件上線將為平臺用戶帶來的便捷之處。
很多老師都知道,CytoScape是一款用來做生物分子網(wǎng)絡(luò)圖的作圖工具,其繪制的網(wǎng)絡(luò)圖可直觀展示基因互作關(guān)系。但對于生信小白來說,學(xué)習(xí)使用CytoScape軟件作圖的時間成本太高,操作起來也是相當(dāng)繁瑣?
NovelBrain®云平臺V3.0上線的GCN功能網(wǎng)絡(luò)可視化軟件,只需幾步簡單的點擊操作和參數(shù)設(shè)置,即可一鍵實現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖的繪制,并可對網(wǎng)絡(luò)節(jié)點的樣式和形狀進行任意修改。用戶如果想用高級功能,也可將數(shù)據(jù)導(dǎo)出并與cytoscape互通。
以下是NovelBrain®可以展示的圖片形式:
GO-Tree網(wǎng)絡(luò)
物種富集網(wǎng)絡(luò)
GCN上線只是NovelBrain®云平臺V3.0更新的眾多內(nèi)容之一,由于篇幅問題,這里不再做過多介紹,對于其他更新板塊感興趣的老師可以直接聯(lián)系我們進行咨詢。NovelBrain®云平臺V3.0也歡迎各位老師進行壓力測試,并向我們提出寶貴的意見和建議。您的支持就是我們的最大動力!更多后續(xù)更新請持續(xù)關(guān)注哦!
至此,NovelBrain®云平臺V3.0成為行業(yè)內(nèi)更懂科研、更了解臨床的生物醫(yī)療云平臺之一,實現(xiàn)了NovelBrain的重大突破。在過去的一個月里,NovelBrain已經(jīng)部署至三家擁有NovaSeq的企業(yè),達(dá)成長期戰(zhàn)略合作意向;
1家大型公有云機構(gòu)達(dá)成意向協(xié)議;2家三甲醫(yī)院達(dá)成醫(yī)療合作框架,聯(lián)合建立臨床檢驗實驗室;與3家臨檢機構(gòu)建立NovelBrain醫(yī)療云開發(fā)平臺。屆時,NovelBrain的公有云注冊用戶突破10000,充值合作用戶突破1000人,培訓(xùn)專業(yè)人數(shù)突破400人。
更振奮的事情是,本次V3.0版本升級,會第一時間更新到老用戶的平臺上,烈冰安全穩(wěn)定可靠的運維體系,為NovelBrain的熱愛者保駕護航。
烈冰8周年
烈冰于2010年成立至今,身經(jīng)百戰(zhàn),數(shù)百篇文獻支持。8年間歷經(jīng)海量數(shù)據(jù)檢驗,已為600+國內(nèi)外機構(gòu)服務(wù)5000+項目,業(yè)務(wù)領(lǐng)域覆蓋科研機構(gòu)、大型藥廠、醫(yī)院、檢驗機構(gòu)等。從國內(nèi)circRNA研究文章(Sci
Rep. 2016 Mar 2;6:22572.)到人類血液外泌體長鏈RNA數(shù)據(jù)庫exoRBase(www.exoRBase.org),從基于Ion
Proton測序儀的第一篇轉(zhuǎn)錄組文獻(BMC Med Genomics. 2014 Aug 9;7:49)到第一篇高分轉(zhuǎn)錄組文獻(Nature. 2016
Feb 4;530(7588):98-102,NovelBrain®云計算平臺身經(jīng)百戰(zhàn),不懼考驗,獻身懂科研!
新的八年,新的考驗,烈冰陪您繼續(xù)前行!