烈冰智造 | 自動(dòng)化組織解離儀:超越傳統(tǒng),精準(zhǔn)揭示小鼠膀胱癌皮下瘤組織的單細(xì)胞奧秘
組織解離樣本 ——小鼠膀胱癌皮下瘤組織
小鼠膀胱癌皮下瘤組織是一種在小鼠皮下移植癌細(xì)胞形成的腫瘤模型,常用于癌癥研究。接下來(lái),我們將對(duì)小鼠膀胱癌皮下瘤組織進(jìn)行同步處理,應(yīng)用烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀與傳統(tǒng)水浴震蕩法進(jìn)行對(duì)比實(shí)驗(yàn),以揭示兩種技術(shù)在組織解離效果上的差異。
實(shí)驗(yàn)方案對(duì)比
1、烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織解離流程:
組織消化
樣本上機(jī)—溫度設(shè)置—物種以及組織類型選擇設(shè)置—點(diǎn)擊運(yùn)行
(觸控界面顯示樣本解離剩余時(shí)間)
過篩(從上圖可以觀察到經(jīng)過烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀進(jìn)行組織消化后碎片、雜質(zhì)非常少)
2、傳統(tǒng)水浴震蕩法組織解離流程:
37℃水浴鍋震蕩
實(shí)驗(yàn)結(jié)果對(duì)比
1、單細(xì)胞懸液質(zhì)控:
以上結(jié)果可以觀察到,利用烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀制備的單細(xì)胞懸液的細(xì)胞活率與傳統(tǒng)水浴震蕩法相當(dāng)。而相較于傳統(tǒng)水浴震蕩法,烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化獲得更高的細(xì)胞濃度以及更多的細(xì)胞數(shù)。這一結(jié)果不僅驗(yàn)證了自動(dòng)化組織解離儀在溫和高效地消化組織方面的優(yōu)異表現(xiàn),也突顯了其高樣本回收率的優(yōu)勢(shì)。
接著利用烈冰智造的NovelCyto平臺(tái)進(jìn)行細(xì)胞捕獲,隨后完成文庫(kù)構(gòu)建,上機(jī)測(cè)序。接著進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,采用烈冰CytoNavigatorTM單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),對(duì)通過烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀處理的小鼠膀胱癌皮下瘤組織樣本與傳統(tǒng)水浴震蕩法所得數(shù)據(jù)結(jié)果的詳細(xì)對(duì)比分析:
2、細(xì)胞質(zhì)控:
烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化和傳統(tǒng)水浴震蕩法均獲得高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù):烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化方法上機(jī)測(cè)序最終捕獲細(xì)胞數(shù)為10737,中位基因值為3017;傳統(tǒng)水浴震蕩法上機(jī)測(cè)序最終捕獲細(xì)胞數(shù)為10729,中位基因值為2805,低于自動(dòng)化組織解離儀的處理結(jié)果。這一結(jié)果展示了烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀獲取高質(zhì)量細(xì)胞和基因表達(dá)的完整性方面的優(yōu)勢(shì)。
3、細(xì)胞類型鑒定以及細(xì)胞計(jì)數(shù)和占比統(tǒng)計(jì):
根據(jù)特征marker基因表達(dá),共鑒定出九種細(xì)胞類型,包括T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞、粒細(xì)胞-巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞。
根據(jù)細(xì)胞計(jì)數(shù)和占比統(tǒng)計(jì)結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)對(duì)于實(shí)質(zhì)細(xì)胞的獲取,烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化得到的內(nèi)皮細(xì)胞數(shù)量為142,成纖維細(xì)胞數(shù)量為459;而傳統(tǒng)水浴震蕩法得到的內(nèi)皮細(xì)胞數(shù)量為64,成纖維細(xì)胞數(shù)量為340。這一顯著的對(duì)比結(jié)果顯示清晰地揭示了烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀在獲取更多數(shù)量的實(shí)質(zhì)細(xì)胞方面的優(yōu)勢(shì)。
4、結(jié)果總結(jié):
通過烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀與傳統(tǒng)水浴震蕩法同步對(duì)小鼠膀胱癌皮下瘤組織進(jìn)行解離消化的對(duì)比實(shí)驗(yàn),從單細(xì)胞懸液質(zhì)控、細(xì)胞質(zhì)控以及獲取不同細(xì)胞類型的數(shù)量等方面比較了兩種組織解離方法的解離效果。烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀在單細(xì)胞懸液制備上展現(xiàn)出以下優(yōu)勢(shì):
(1)解離獲得的單細(xì)胞懸液碎片、雜質(zhì)更少
(2)獲取的單細(xì)胞懸液的細(xì)胞濃度更高,數(shù)量更多
(3)獲取細(xì)胞的基因表達(dá)完整性更好
(4)對(duì)實(shí)質(zhì)細(xì)胞解離效果更好
烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀
烈冰智造的組織解離儀可將各類組織快速、徹底的解離為高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。儀器的金屬浴模塊提供了精準(zhǔn)溫控,螺旋槳式攪拌頭提供了柔和且穩(wěn)定的剪切力,相較于傳統(tǒng)方法,解離效率大幅提升。
傳統(tǒng)水浴震蕩法
VS
烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化
傳統(tǒng)的組織解離消化方法主要是通過水浴鍋震蕩的方式實(shí)現(xiàn),可能出現(xiàn)以下問題:
1.消化均勻性有偏差:震蕩消化可能無(wú)法保證組織樣本在水浴鍋中均勻受熱,導(dǎo)致消化不徹底或過度消化。
2.溫度控制不精確:水浴鍋可能難以提供精確的溫度控制,導(dǎo)致消化過程中溫度波動(dòng),影響酶的活性和細(xì)胞的完整性。
3.存在潛在的交叉風(fēng)險(xiǎn):在多次消化過程中,使用相同的水浴鍋可能會(huì)增加樣本間交叉污染的風(fēng)險(xiǎn)。
4.可能存在實(shí)驗(yàn)批次效應(yīng):由于依賴于操作者的經(jīng)驗(yàn)和技巧,傳統(tǒng)方法難以實(shí)現(xiàn)操作的標(biāo)準(zhǔn)化,這可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的批次間差異。
烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀組織消化
相比之下,烈冰智造自動(dòng)化組織解離儀可以有效克服這些不足,提高實(shí)驗(yàn)的效率和結(jié)果的可靠性。產(chǎn)品核心優(yōu)勢(shì)主要有:
1.波輪與樣本非硬擠壓解離模式:使得組織所受的機(jī)械壓力最小化,從而保護(hù)了細(xì)胞的完整性和活性。同時(shí)正置旋轉(zhuǎn)技術(shù)確保了樣本在消化過程中的均勻受力,適用于各類軟硬組織。
2.精準(zhǔn)溫控:金屬浴模塊實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)溫控,迅速散熱,確保細(xì)胞活性,這一功能對(duì)于溫度敏感的細(xì)胞類型尤為重要,能夠有效避免溫度波動(dòng)對(duì)細(xì)胞功能和完整性的不利影響。
3.交叉污染風(fēng)險(xiǎn)低:一次性耗材的使用顯著降低了交叉污染風(fēng)險(xiǎn),確保了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的精準(zhǔn)可靠。
4.實(shí)驗(yàn)批次效應(yīng)小:儀器可提供高度一致的消化效果,減少了實(shí)驗(yàn)批次間的變異,保證了數(shù)據(jù)的一致性和可比性。
5.多樣化消化方案:針對(duì)不同組織類型的定制化消化方案,以適應(yīng)各種組織的特性,從而提升實(shí)驗(yàn)效率,確保樣本處理的一致性和結(jié)果的準(zhǔn)確性。